Bolnički informacioni sistem, kao dio budućeg cjelovitog zdravstvenog informacionog sistema, omogućava Ministarstvu zdravlja i socijalne zaštite da na veoma brz i jednostavan način prikupi informacije i izvrši analizu poslovanja bolničkog sistema u cjelini, kao i pojedinih njegovih segmenata. Na osnovu ovih informacija i analiza Ministarstvo može da preduzme odgovarajuće mjere sa ciljem:

Konačni rezultat je izgradnja kvalitetnijeg, racionalnijeg i efikasnijeg zdravstvenog sistema i sistema zdravstvenog osiguranja.

• na osnovu egzaktnih informacija o potrošnji lijekova i materijala stiče se uvid u stvarnu potrošnju i mjesta neprimjerene potrošnje. Zatim se primjenjuju odgovarajuća softverska rješenja za brzu i efikasnu racionalizaciju potrošnje (HIC farmakoterapijske preporuke, “Drugs interactios“, “Cost-effectivness“ lista lijekova, itd.)
  
• objektivni podaci o ukupnoj iskorištenosti ljudskih i materijalnih kapaciteta omogućavaju racionalizaciju i balansiranje mreže zdravstvenih ustanova
  
• uvoÄ‘enjem elektronskih uputnica i elektronskog zakazivanja pacijenata značajno se olakšava rad zaposlenog osoblja, liste čekanja postaju transparentne, a istovremeno se smanjuje broj izgubljenih radnih sati zbog posjete ljekaru, itd.